Bonjour Schwing,
En effet, vous pourrez toujours bénéficier des aides de la CAF pour vos 2 filles. Dès lors que votre fils bénéficie des Aides Personnalisées au Logement (APL), il n'est plus considéré comme étant à votre charge. Si vos deux autres filles sont, elles, encore à votre charge, vous aurez droit à des prestations CAF pour ces dernières.
La notion d'enfant à charge CAF est expliquée ici :
https://www.aide-sociale.fr/caf-enfant-a-charge/
Je vous conseille par ailleurs de vous rapprocher directement de la CAF pour savoir dans quelle mesure le fait que votre fils touche les APL peut impacter le montant de vos aides CAF. Toutes les informations pour contacter un conseiller CAF sont ici :
https://www.aide-sociale.fr/contacter-caf/
Cordialement.